はじめてのQuarto

茅根健 (Takeru Chinone)

イーピーエス株式会社

2026-04-08

発表の目的

はじめて Quarto に触れる方、あまり触れたことがない方を対象に Quarto を知っていただくこと

注意事項

Quarto は内容が多岐にわたるため、すべてをカバーする内容となっておりません
詳細や不明点は公式サイトをご確認ください
- quarto
発表スライドは以下
- https://chinot8.github.io/R-with-Pharma-Lab01

1. Quarto とは

2. Quarto の事例紹介

3. Quarto に触れてみよう

4. まとめ

とは

Posit 社が開発したオープンソースの科学技術文書作成システム
- quarto
コード/実行結果/数式/文章を1つのソースから文書やスライドとして生成
R/Python/Julia など複数の言語を同じ文書内で使用可能
HTML/PDF/Word/PowerPoint など様々な形式で文書やスライドを生成可能
ファイルの拡張子は .qmd

Allison Horst

具体例 1/2

library(tidyverse)

ggplot(mpg, aes(x = hwy, y = cty, color = cyl)) +
  geom_point(alpha = 0.5, size = 2) +
  scale_color_viridis_c() +
  theme_minimal()

具体例 2/2

Quarto Gallery

Quarto の強み

コード/実行結果/数式/文章を1つのソースから文書やスライドとして生成
ソースコードを修正するだけで、文書やスライドの内容を更新可能
R/Python/Julia など複数の言語を同じ文書内で使用可能
HTML/PDF/Word/PowerPoint など様々な形式で文書やスライドを生成可能
公式サイトなど情報が豊富
- quarto

1. Quarto とは

2. Quarto の事例紹介

3. Quarto に触れてみよう

4. まとめ

CAMIS

PHUSE、PSI、ASA、IASCT の各団体メンバーと共同で運営されている、業界横断的な PHUSE DVOST WG
- CAMIS (Comparing Analysis Method Implementations in Software)
本プロジェクトの目的は、主に SAS、R、Python といったプログラミング言語間における統計解析手法や解析結果の差異を解明するため、それらの類似点と相違点について比較と包括的な説明を行うこと

そのほかの事例

Documents
Dashboard
- Palmer Penguins Cobblepot Analytics
Quarto Live Documentation
- Interactive Code Blocks

R Submission Pilot

R を使用した FDA submission の実証実験
R で作成したデータセット、解析結果、R のパッケージや実行環境で FDA 申請でき、レビュー側が再現、評価できるか、何が課題かを検証することが目的
- R Submissions Working Group
- R Submissions Working Group: 2026 Plans and 2025 Success
Pilot 5 では ADRG (Analysis Data Reviewer’s Guide) が Quarto で作成された
- ADRG
- adrg.qmd

1. Quarto とは

2. Quarto の事例紹介

3. Quarto に触れてみよう

4. まとめ

Quarto に触れてみよう 1/3

RStudio起動 → File → New File → Quarto Document…
Use visual markdown editor のチェックを外す
Create
- qmd ファイルが作成される
- コードを修正すれば、別の形式の文書作成に変更可能

Quarto に触れてみよう 2/3

qmd ファイルを保存し、Render をクリック

YAMLヘッダー
- タイトル、サブタイトル、著者、日付などのメタデータや、テーマや目次などを設定する
- 使用可能なYAMLフィールドは文書形式によって異なる

Quarto に触れてみよう 3/3

html ファイルが作成できた!!

---
title: "Untitled"
format:
  html:
    embed-resources: true
---

embed-resources : true xxx_files フォルダを作成せず、画像・CSS などの情報をすべて html ファイル内にすべて埋め込み、html ファイルのみを作成

ここまで Quarto に触れてみて…

実装することは難しいのではないか？
コードを見ると複雑そう…
Quarto の事例や情報は豊富

Quarto の事例や情報は豊富 1/5

Guide|quarto

Quarto の事例や情報は豊富 2/5

Gallery|quarto

Quarto の事例や情報は豊富 3/5

Gallery|quarto
ソースコード (.qmd) をダウンロード可能

Quarto の事例や情報は豊富 4/5

ダウンロードしたファイルを RStudio で開き Render をクリック
RStudio 以外で実行する場合は公式サイトから Quarto のインストールが必要
- Get Started|quarto

Quarto の事例や情報は豊富 5/5

結果が再現できた!!

シミュレーションや例数設計にも活用可能

cache を設定すれば不要な再実行なく、レンダリング可能

1. Quarto とは

2. Quarto の事例紹介

3. Quarto に触れてみよう

4. まとめ

Quarto

コード/実行結果/数式/文章を1つのソースから文書やスライドとして生成
データやコードを修正 → Render のみで文書やスライドを更新可能
HTML/PDF/Word/PowerPoint など様々な形式で文書やスライドを生成可能
オープンソースであるため情報が豊富
使用事例も豊富で、活用範囲も広い

Quarto 関連リンク

backup

YAMLヘッダー (文書作成用) 1/2

title: "タイトル"
subtitle: "サブタイトル"
date: yyyy-mm-dd # today と記載すれば実行日
author: "著者"

format:
  html: # 出力形式
    toc: true # 目次の作成
    toc-depth: 2 # 目次の階層
    number-sections: true # 章番号
    embed-resources: true # 自己完結する html ファイル作成
    code-fold: true # コードの折り畳み
    code-copy: true # コードコピーボタンの表示

execute: # コードの実行・表示形式の設定
  echo: true # コードを出力ファイルに表示, false : 非表示
  warning: false # warning を出力ファイルに表示, false : 非表示

YAMLヘッダー (文書作成用) 2/2

右上の Code → View Source よりソースコードのコピーが可能
詳細は quarto、私たちのRを参照

YAMLヘッダー (スライド作成用)

title: "タイトル"
subtitle: "サブタイトル"
date: yyyy-mm-dd # today と記載すれば実行日
author: "著者"

format:
  revealjs: 
    theme: default # デザイン設定
    embed-resources: true # 自己完結する html ファイル作成
    slide-number: true # スライド番号の表示
    code-copy: true # コードコピーボタンの表示

execute: # コードの実行・表示形式の設定
  echo: true　# コードを出力ファイルに表示, false : 非表示
  warning: false　# warning を出力ファイルに表示, false : 非表示